Il Santuario ha origine da un fatto prodigioso: siamo nel 1522 quando in Lombardia si combatte la guerra tra francesi e spagnoli. I trevigliesi non vedono altra salvezza dall'assedio francese che nell'intervento della Madonna.Si raccomandano in preghiera e vedono la venerata immagine spargere abbondanti lacrime e sudore. Le lacrime della Vergine salvano la città di Treviglio dal saccheggio e dalla vendetta dei francesi.Il miracolo si verifica la mattina del 28 febbraio 1522. La prima pietra del nucleo originario del Santuario viene posta il 25 marzo 1594, su progetto dell'architetto romano Tolomeo Rinaldi. Nel 1897 l'architetto milanese Carlo Nava progetta l'attuale ampliamento. La Chiesa viene ufficialmente consacrata dal Cardinal Ferrari il 9 agosto 1902.
